تقع في أقصي غرب فلسطين علي بعد 13كم من الحدود المصرية وأصبحت بعد عام 48 ثاني مدينة في قطاع غزة بعد مدينة غزة. تتمتع بموقع جغرافي مهم فهي بوابة فلسطين الجنوبية. فقد ارتبطت خان يونس بالنقب بطريق يتجه شرقاً عبر قري بني سهيلة، عبسان، وخزاعة وهي تمثل نقطة انقطاع بين بيئة النقب الصحراوية وبيئة السهل الساحلي.. بنيت خا ن يونس علي أطلال مدينة قديمة كانت تعرف باسم (جنيس) ذكرها هيرودوس أنها تقع جنوبي مدينة غزة. وعرفت باسم خان يونس عندما أنشأ الأمير يونس النوروزي الدوادار قلعة في هذا الموقع لخدمة التجارة والمسافرين وأطلق عليها الخانعام 1387م. يوجد فيها مجلس بلدي تأسس عام 1918م. وتعتبر المدينة مركزاً إدارياً وتعليمياً لجنوب قطاع غزة يتركز فيها الكثير من الدوائر الحكومية وعشرات المدارس لمختلف المراحل الدراسية وللبنين والبنات واستولت سلطات الاحتلال علي جزء كبير من أراضيها لبناء المستوطنات عليها <